Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg9Q9DB90 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Smg9Q9DB90 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Smg9Q9DB90 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Smg9Q9DB90 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Smg9Q9DB90 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Smg9Q9DB90 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Smg9Q9DB90 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Smg9Q9DB90 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Smg9Q9DB90 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Smg9Q9DB90 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg9Q9DB90 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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