Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms