Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdzd9Q9D9M4 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Pdzd9Q9D9M4 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Pdzd9Q9D9M4 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdzd9Q9D9M4 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms