Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Sfxn2-201ENSMUST00000026011 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42669-202ENSMUST00000160160 3080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Serpinb1a-201ENSMUST00000076352 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7340-201ENSMUST00000119729 2752 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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