Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn23Q9D7D7 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms