Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms