Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdr42e1Q9D665 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdr42e1Q9D665 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdr42e1Q9D665 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sdr42e1Q9D665 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Sdr42e1Q9D665 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sdr42e1Q9D665 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sdr42e1Q9D665 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sdr42e1Q9D665 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sdr42e1Q9D665 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sdr42e1Q9D665 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms