Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ptp4a3Q9D658 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms