Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Lonrf3Q9D4H7 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Lonrf3Q9D4H7 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Lonrf3Q9D4H7 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Lonrf3Q9D4H7 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Lonrf3Q9D4H7 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Lonrf3Q9D4H7 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Lonrf3Q9D4H7 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Lonrf3Q9D4H7 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Lonrf3Q9D4H7 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Lonrf3Q9D4H7 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Lonrf3Q9D4H7 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Lonrf3Q9D4H7 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Lonrf3Q9D4H7 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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