Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pabpc6Q9D4E6 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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