Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Syce1Q9D495 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Syce1Q9D495 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Syce1Q9D495 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Syce1Q9D495 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Syce1Q9D495 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Syce1Q9D495 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Syce1Q9D495 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Syce1Q9D495 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syce1Q9D495 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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