Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UvssaQ9D479 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UvssaQ9D479 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UvssaQ9D479 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UvssaQ9D479 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UvssaQ9D479 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UvssaQ9D479 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UvssaQ9D479 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UvssaQ9D479 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UvssaQ9D479 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UvssaQ9D479 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UvssaQ9D479 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UvssaQ9D479 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UvssaQ9D479 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UvssaQ9D479 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UvssaQ9D479 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UvssaQ9D479 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UvssaQ9D479 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UvssaQ9D479 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UvssaQ9D479 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UvssaQ9D479 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UvssaQ9D479 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UvssaQ9D479 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UvssaQ9D479 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UvssaQ9D479 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UvssaQ9D479 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UvssaQ9D479 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UvssaQ9D479 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UvssaQ9D479 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UvssaQ9D479 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UvssaQ9D479 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UvssaQ9D479 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UvssaQ9D479 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UvssaQ9D479 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UvssaQ9D479 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UvssaQ9D479 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UvssaQ9D479 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UvssaQ9D479 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UvssaQ9D479 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UvssaQ9D479 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UvssaQ9D479 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms