Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D454 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D454 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D454 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D454 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D454 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D454 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D454 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D454 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D454 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D454 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D454 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D454 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D454 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D454 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D454 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D454 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D454 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D454 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D454 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D454 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D454 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D454 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D454 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D454 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D454 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D454 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D454 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D454 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D454 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D454 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D454 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D454 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D454 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D454 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D454 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D454 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D454 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D454 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D454 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D454 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D454 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D454 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D454 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D454 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D454 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D454 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D454 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D454 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D454 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D454 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D454 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D454 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D454 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D454 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D454 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D454 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D454 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms