Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1U0

Grifin, Grifin, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GrifinQ9D1U0 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GrifinQ9D1U0 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
GrifinQ9D1U0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms