Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms