Protein–RNA interactions for Protein: Q9D032

Ssbp3, Single-stranded DNA-binding protein 3, mousemouse

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp3Q9D032 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp3Q9D032 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp3Q9D032 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp3Q9D032 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp3Q9D032 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp3Q9D032 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp3Q9D032 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp3Q9D032 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp3Q9D032 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp3Q9D032 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp3Q9D032 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp3Q9D032 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp3Q9D032 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssbp3Q9D032 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Ssbp3Q9D032 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Ssbp3Q9D032 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Ssbp3Q9D032 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Ssbp3Q9D032 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp3Q9D032 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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