Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc47Q9D024 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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