Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shmt2Q9CZN7 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shmt2Q9CZN7 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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