Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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