Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Cnih4Q9CX13 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Cnih4Q9CX13 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Cnih4Q9CX13 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Cnih4Q9CX13 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Cnih4Q9CX13 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Cnih4Q9CX13 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Cnih4Q9CX13 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Cnih4Q9CX13 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Cnih4Q9CX13 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Cnih4Q9CX13 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms