Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpusd4Q9CWX4 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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