Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q9CRC3 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q9CRC3 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q9CRC3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q9CRC3 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms