Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
StambpQ9CQ26 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms