Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prpf8Q99PV0 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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