Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms