Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pagr1aQ99L02 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms