Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ciao1Q99KN2 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms