Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlgn1Q99K10 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 801 ms