Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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TrabdQ99JY4 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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TrabdQ99JY4 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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TrabdQ99JY4 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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TrabdQ99JY4 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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TrabdQ99JY4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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TrabdQ99JY4 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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TrabdQ99JY4 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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TrabdQ99JY4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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TrabdQ99JY4 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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TrabdQ99JY4 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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TrabdQ99JY4 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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TrabdQ99JY4 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms