Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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