Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim11aQ99J19 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 211.9 ms