Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
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