Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms