Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Smg8Q8VE18 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Smg8Q8VE18 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Smg8Q8VE18 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Smg8Q8VE18 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Smg8Q8VE18 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Smg8Q8VE18 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Smg8Q8VE18 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smg8Q8VE18 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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