Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc39cQ8VE09 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc39cQ8VE09 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc39cQ8VE09 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39cQ8VE09 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39cQ8VE09 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39cQ8VE09 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39cQ8VE09 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39cQ8VE09 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39cQ8VE09 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39cQ8VE09 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39cQ8VE09 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39cQ8VE09 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39cQ8VE09 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39cQ8VE09 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39cQ8VE09 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39cQ8VE09 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39cQ8VE09 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39cQ8VE09 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39cQ8VE09 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39cQ8VE09 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39cQ8VE09 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39cQ8VE09 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39cQ8VE09 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39cQ8VE09 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39cQ8VE09 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39cQ8VE09 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39cQ8VE09 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39cQ8VE09 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39cQ8VE09 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39cQ8VE09 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39cQ8VE09 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39cQ8VE09 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39cQ8VE09 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39cQ8VE09 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39cQ8VE09 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39cQ8VE09 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc39cQ8VE09 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms