Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d2Q8VD57 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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