Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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RfxapQ8VCG9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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RfxapQ8VCG9 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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RfxapQ8VCG9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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RfxapQ8VCG9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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RfxapQ8VCG9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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RfxapQ8VCG9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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RfxapQ8VCG9 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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RfxapQ8VCG9 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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RfxapQ8VCG9 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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RfxapQ8VCG9 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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