Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms