Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vmn1r72Q8K3N7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms