Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3J1

Ndufs8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs8Q8K3J1 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Ndufs8Q8K3J1 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Ndufs8Q8K3J1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Ndufs8Q8K3J1 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Ndufs8Q8K3J1 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufs8Q8K3J1 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms