Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SrrdQ8K2M3 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms