Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gtf3c1Q8K284 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtf3c1Q8K284 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms