Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Nek9Q8K1R7 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek9Q8K1R7 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms