Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrit1Q8K099 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrit1Q8K099 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms