Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

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Length 878 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pkn3Q8K045 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pkn3Q8K045 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pkn3Q8K045 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pkn3Q8K045 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Pkn3Q8K045 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkn3Q8K045 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms