Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Afg3l2Q8JZQ2 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms