Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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LgsnQ8CIX8 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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LgsnQ8CIX8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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LgsnQ8CIX8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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LgsnQ8CIX8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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LgsnQ8CIX8 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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LgsnQ8CIX8 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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LgsnQ8CIX8 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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LgsnQ8CIX8 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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LgsnQ8CIX8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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LgsnQ8CIX8 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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LgsnQ8CIX8 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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