Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Upp2Q8CGR7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Upp2Q8CGR7 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms