Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Hpf1Q8CFE2 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Hpf1Q8CFE2 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Hpf1Q8CFE2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hpf1Q8CFE2 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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