Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg4aQ8C9S8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Atg4aQ8C9S8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Atg4aQ8C9S8 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4aQ8C9S8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4aQ8C9S8 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4aQ8C9S8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Atg4aQ8C9S8 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Atg4aQ8C9S8 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4aQ8C9S8 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4aQ8C9S8 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4aQ8C9S8 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4aQ8C9S8 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4aQ8C9S8 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Atg4aQ8C9S8 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4aQ8C9S8 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms